制药厂的工艺流程设计是一项非常复杂而细致的工作，除极少数非常简单又比较成熟的工艺流程外，都要经过由浅入深、由定性到定量、反复推敲和不断完善的过程。一般地，工艺流程设计可按以下基本程序进行。

一、工艺路线的选择

当一种产品存在若干种不同的工艺路线时，应从工业化实施的可行性、可靠性和先进性的角度，对各工艺路线进行全面细致的分析和研究，并确定一条最优的工艺路线，作为工艺流程设计的依据。

在选择工艺路线时，应特别注意工艺路线中所涉及的关键设备和特殊工艺条件或参数。一些工艺路线常常因为解决不了工业化时的关键设备或难以满足所需的操作条件或参数，而不能实现工业化。

二、确定工艺流程的组成和顺序

根据选定的工艺路线，确定工艺流程的组成，包括全部单元反应和单元操作，并明确各单元反应和单元操作的主要设备、操作条件和基本操作参数（如温度、压力、浓度等）。在此基础上，确定各设备之间的连接顺序以及载能介质的技术规格和流向。

三、绘制工艺流程框图

当工艺路线及工艺流程的组成和顺序确定之后，可用方框、圆框、文字和箭头等形式定性表示出由原料变成产品的路线和顺序，绘制出工艺流程框图。

四、绘制工艺流程示意图

在工艺流程框图的基础上，分析各过程的主要工艺设备，在此基础上，以图例、箭头和必要的文字说明定性表示出由原料变成产品的路线和顺序，绘制出工艺流程示意图。

五、绘制物料流程图

当工艺流程示意图确定之后，即可进行物料衡算和能量衡算。在此基础上，可绘制出物料流程图。此时，设计已由定性转入定量。

六、绘制初步设计阶段带控制点的工艺流程图

当物料流程图确定之后，即可进行设备、管道的工艺计算以及仪表自控设计。在此基础上，可绘制出初步设计阶段带控制点的工艺流程图，并列出设备一览表。

七、绘制施工阶段带控制点的工艺流程图

初步设计阶段的工艺流程设计经审查批准后，按照初步设计的审查意见，对工艺流程图中所选用的设备、管道、阀门、仪表等作必要的修改、完善和进一步的说明。在此基础上，可绘制出施工阶段带控制点的工艺流程图。

当然，上述设计程序不是一成不变的。根据工程项目的难易程度和设计人员的技术水平，工艺流程的设计程序会有所不同。例如，对一些难度不大、技术又非常成熟的小型工程项目，经验丰富的设计人员甚至可以直接设计出施工阶段带控制点的工艺流程图。