药厂净化车间和其他工业净化车间的不同之处在于不仅依靠空气过滤的方法，使送入室内的空气中的生物或非生物的微粒数量受到严格控制；同时还要对室内器具、地面、壁板等表面进行消毒灭菌处理。为此，生物净化车间除了满足一般净化车间要求外，其内部材料还要能经受得起各种灭菌剂的侵蚀。通过亚高效或高效过滤器过滤的空气可视为无菌空气。但过滤仅是一种除菌手段，并没有杀菌作用，由于室内有人员、物料等污染源存在，净化车间内只要有微生物所需要的营养源存在的地方，就有可能存在微生物的生存、繁殖。因此，生物洁净室设计决不可忽视消毒灭菌措施繁殖

一、无菌制剂操作室的清扫灭菌

无菌室、室内设备、器具和杂物、传递室或传递窗及更衣室的清洗最好采用水洗。对典型部位的清扫和灭菌方法如下所示。

1、整个房间：用石碳酸或甲醛水喷雾消毒，如果每天连续使用同一种消毒液，细菌就会产生抗药性，因此要跟换消毒液的种类。

2、地板：使用软管、湿式电气清扫机进行水洗。

3、壁面：水洗或水擦拭

4、顶棚：水洗或水擦拭

5、设备、器具和杂物：水洗和擦拭后、灭菌或消毒。但有可能直接接触药剂的器具，不能粘附消毒液，一旦粘附，立即将消毒液擦拭干净

6、原料和搬入室内的器材等必须在传递室或传递窗中用杀菌灯照射和消毒。

二、非无菌制剂操作室的清扫消毒

非无菌制剂净化车间的清扫消毒，一般采用普通的清扫消毒方法。